在某地应急管理部门首次检查一项目时，发现有两家生产经营单位在同一作业区域内活动，存在潜在的安全生产风险，且未签订安全生产管理协议。依据《安全生产法》，下列哪些处罚是适当的？

根据《安全生产法》第一百零四条的规定，对于两个生产经营单位在同一作业区域内进行生产经营活动，可能危及对方安全生产，但未签订安全生产管理协议的情况，应急管理部门首次检查发现时，应责令限期改正，并处以5万元以下的罚款。因此，选项A“责令限期改正”和选项D“对企业处以3万元罚款”是恰当的处罚措施。而选项B“责令停产停业”、选项C“对直接责任人处以5万元罚款”和选项E“警告”在此情境下并未被提及作为首次检查的处罚措施。