关于《危险化学品输送管道安全管理规定》，管道单位发现下列哪些行为应当及时制止？

根据《危险化学品输送管道安全管理规定》，在危险化学品管道及其附属设施外缘两侧各5米地域范围内，管道单位发现下列行为应当及时予以制止：

（1）种植根系深达管道埋设部位可能损坏管道防腐层的深根植物，如种植芦苇。因此选项D中的行为应当及时制止。

（2）取土、采石、用火、堆放重物、排放腐蚀性物质、使用机械工具进行挖掘施工、工程钻探等行为，这些行为都可能对管道的安全运行构成威胁。但选项A、B、C中的行为并未明确列出，所以不是正确答案。