甲公司发包管道改造项目，由乙公司承担土方开挖工程，丙公司承担管道安装工程，丁公司负责施工监理，乙公司和丙公司需要同时在同一区域内施工，根据《安全生产法》，关于作业安全管理的做法，正确的有（）。

本题考查《安全生产法》的相关规定。
《安全生产法》第四十八条规定，两个以上生产经营单位在同一作业区域内进行生产经营活动，可能危及对方生产安全的，应当签订安全生产管理协议，明确各自的安全生产管理职责和应当采取的安全措施，并指定专职安全生产管理人员进行安全检查与协调。因此，选项A“甲公司分别与乙公司、丙公司签订安全生产管理协议”、选项B“乙公司与丙公司签订安全生产管理协议”、选项D“乙公司和丙公司指定专职安全生产管理人员进行安全检查与协调”均正确。而选项C“甲公司与乙、丙公司共同签订安全生产管理协议”与法律规定不符。
关于选项E，《安全生产法》第四十九条规定了生产经营单位将项目发包或出租时的安全生产管理要求，但并没有规定可以由丁公司负责统一协调管理整个项目的安全生产，因此选项E不正确。