甲公司从事危险化学品生产，乙公司从事燃煤发电，丙公司从事煤矿开采，丁公司从事机械设备制造。根据《建设项目安全设施“三同时”监督管理办法》，关于该四家公司扩建项目安全设施“三同时”的说法，正确的是（）。

根据《建设项目安全设施"三同时"监督管理办法》的规定，对于从事危险化学品生产的甲公司、从事燃煤发电的乙公司和从事煤矿开采的丙公司，在扩建项目完成后，应当组织对安全设施进行竣工验收，并形成书面报告备查。这是符合规定的做法，因此选项A是正确的。

对于选项B，只有非煤矿矿山、生产储存危险化学品等特定类型的建设项目才需要委托安全评价机构进行安全预评价，而机械设备制造的丁公司不属于此类特定项目，因此不需要进行安全预评价。所以选项B是错误的。

对于选项C，只有非煤矿矿山、生产储存危险化学品等特定类型的建设项目的安全设施设计完成后，才需要向应急管理部提出审查申请。在本题中，只有甲公司的扩建项目属于此类特定项目，因此只有甲公司需要提出审查申请。所以选项C是错误的。

对于选项D，只有非煤矿矿山、生产储存危险化学品等特定类型的建设项目在竣工或试运行完成后，才需要委托安全评价机构对安全设施进行验收评价。在本题中，只有甲公司和丙公司的扩建项目属于此类特定项目，因此只有这两家公司需要委托安全评价机构进行验收评价。所以选项D是错误的。