某气瓶充装单位擅自转移被执法机关查封的气瓶，情节严重，其充装许可证于2018年6月30日被依法吊销。根据《特种设备安全法》，特种设备安全监督管理部门不予受理该单位新的许可申请的截止时间为（ ）。

根据《特种设备安全法》第九十六条的规定，违反本法规定，被依法吊销许可证的充装单位，自吊销许可证之日起三年内，特种设备安全监督管理部门不予受理其新的许可申请。因此，该单位充装许可证于2018年6月30日被吊销，不予受理新的许可申请的截止时间应为2021年6月30日。所以正确答案为C。