下列选项中，对新建、改建、扩建工程“三同时”的组织审查、验收、上报、备案的执行程序等作出明确规定的应当是？

对新建、改建、扩建工程"三同时"的组织审查、验收、上报、备案的执行程序等作出明确规定的应当是设备设施安全管理制度。这是因为在工程建设过程中，设备设施的布局、设计和安装等对于整个工程的安全性至关重要。因此，需要制定专门的设备设施安全管理制度来确保这些工作的安全进行，其中就包括了对新建、改建、扩建工程的"三同时"制度的规定。所以，正确答案是C。