某金属冶炼单位新成立分公司，计划新建炼钢项目，需办理建设项目安全设施设计审查。分公司向当地应急管理部门提交审查申请材料，其中必须包含哪些资料？

根据题目描述和参照解析，金属冶炼建设项目在办理安全设施设计审查时，必须提交的资料包括建设项目安全设施设计审查申请。因此，分公司主要负责人填写的安全设施设计审查申请是必须提交的资料，选项B正确。而选项A中的公司总部签发的核准文件并不是必须提交的资料；选项C中的建设项目施工单位的资质证明文件不属于必须提交的资料；选项D中的企业组织专业人员编制的安全评估报告也不属于必须提交的资料。因此，正确答案为B。