关于安全生产管理的相关措施，以下哪项是由地方政府依法予以关闭的情况？

根据《国务院关于进一步加强安全生产工作的决定》规定，对于以整合、技改名义违规组织生产，以及规定期限内未实施改造或故意拖延工期的矿井，由地方政府依法予以关闭。因此，选项D是正确答案。其他选项如责令停产停工整顿、依法给予规定上限的经济处罚等，虽然也是安全生产管理的重要措施，但不是由地方政府依法予以关闭的情况。