根据安全资质审查的要求和参照解析,企业应准备的资料包括:安全生产许可证、主要负责人安全资格证书、安全管理体系有效评审报告以及近两年的安全业绩。这些资料能够证明企业的安全资质和安全管理水平,符合安全资质审查的要求。因此,选项D是正确答案。