工期索赔的主要依据包括:A 合同约定的施工总进度规划、B 施工日志、C 业主的变更指令、D 受干扰后实际工程进度。这些依据是承包人向发包人提出工期索赔时的主要参考,符合题干中提到的索赔依据要求。而选项E“施工质量资料”并不是工期索赔的主要依据,因此不选。