社会投资项目采用预留保证金方式时，发承包双方应如何选择保证金的托管机构？

社会投资项目采用预留保证金方式的，发承包双方可以约定将保证金交由金融机构托管。故选项A正确。其他选项如发包人、财政部、政府部门均不是预留保证金的托管方。