编制建设项目竣工决算文件时，下列建设项目投资支出，应计入待核销基建支出的是（）。

待核销基建支出包括不能形成资产的支出，如城市绿化、水土保持等。选项D中的城市绿化和不能形成资产的水土保持支出应计入待核销基建支出。而选项A中的报废工程净损失、设备盈亏及损毁支出应计入待摊投资支出；选项B中的办公生活用家具、器具购置支出和选项C中的软件研发不能计入设备投资的软件购置支出均属于其他投资支出。因此，正确答案为D。