承包人在编制期中支付文件时，已完工程进度款支付申请中应包括的内容有（  ）。

承包人在编制期中支付文件时，已完工程进度款支付申请中应包括的内容有：累计已完成的合同价款、本周期应扣回的预付款、本周期已完成的计日工价款、本周期应支付的安全文明施工费。而特殊设备安全监督检验费属于工程建设其他费用中的工程咨询服务费，是建设单位在建设过程中委托咨询机构提供服务所需的费用，并不包含在已完工程进度款支付申请中。因此，选项D是错误的。