基本预备费支出范围包括超规超限设备运输增加的费用。而选项A“超规超限设备运输增加费”符合这一范围。选项B“人工、材料、施工机具的价差费”和选项C“建设期内利率调整增加费”属于价差预备费的范围,并不属于基本预备费支出范围。而选项D“未明确项目的准备金”并未明确说明其是否属于基本预备费支出范围,因此也不作为正确答案。