关于改变关键线路和超过计划工期的非关键线路上的工作逻辑关系的措施，以下哪些选项是正确的？

根据题目描述，改变关键线路和超过计划工期的非关键线路上的有关工作之间的逻辑关系的措施主要包括将顺序作业改为平行作业、搭接作业以及分段组织流水作业。因此，选项A“将顺序作业改为平行作业”和选项E“搭接作业以及分段组织流水作业”是正确的答案。而选项B“提高劳动效率”、选项C“增加资源投入”和选项D“采用轮班工作制”并不属于改变逻辑关系的措施，因此不是正确答案。