在估算项目的经营成本时，应从总成本费用中扣除哪些费用？

估算项目的经营成本时，需要在总成本费用中扣除的部分包括折旧费、摊销费和利息支出。这些费用不属于经营成本的范围，因此需要在计算时予以扣除。选项B、D、E分别对应折旧费、摊销费和利息支出，是正确答案。而选项A的工资及福利费、选项C的燃料和动力费是属于经营成本的一部分，不需要扣除。