如果每年年初存入银行100万元，年利率3%，按年复利计算，则第三年年末的本利和为（）万元。

根据题目描述，每年年初存入银行100万元，年利率为3%，按年复利计算。为了计算第三年年末的本利和，我们需要考虑每年年初的存款在第三年年末的复利累积。具体来说，第一年年初的存款在第三年年末的价值为 100 × (1 + 3%)³，第二年年初的存款在第三年年末的价值为 100 × (1 + 3%)²，而第三年年初的存款在第三年年末的价值为 100 × (1 + 3%)。将这三年的价值相加，得到第三年年末的本利和。经过计算，第三年年末的本利和为 318.36万元，因此正确答案为C。