投标文件偏差中,属于重大投标偏差的情况包括:提供的担保存在瑕疵、投标文件载明的招标项目完成期限超过招标文件规定的期限以及投标文件载明的货物包装方式不符合要求。因此,选项A、D和E都是正确的。其他选项如报价中存在个别漏项、投标总价金额与依据单价计算结果不一致等不属于重大偏差。