工程项目经济评价应遵循的基本原则包括:效益与费用计算口径对应一致、收益与风险权衡、以定量分析为主。因此,选项B、C、D是正确的答案。而选项A以财务效率为主、选项E以微观效益分析为主并未在原则中明确提出,故排除。