土地增值税采用超率累进税率进行计税,具体税率根据税法规定分为四级超率累进税率。其他选项中,增值税采用比例税率,企业所得税采用比例税率,契税则根据具体情况可能采用不同的税率,但不包括超率累进税率。因此,答案为D。