关于工程计量的计算规则，下列说法正确的是（ ）

关于工程计量的计算规则，题目中给出的四个选项解析如下：

A项，图纸工程量的计算是按照《水利水电工程设计工程量计算规定》（SL 328—2005）的规定，根据设计几何轮廓尺寸计算出的工程量，再乘以工程量阶段系数得到设计工程量，所以A项是正确的。

B项，采用的规范或定额不同，工程量计算规则也会有所不同。因此，B项的说法并不准确。

C项，工程量计算规则是工程计量的主要依据之一，是工程量数值的取定方法，但并不是说工程量计价规则就是工程量数值的取定方法，所以C项描述不准确。

D项，施工过程中，由于施工超挖引起的超填量以及操作损耗所发生的施工余量不计算工程量，但该部分费用可以摊入有效工程量的工程单价中。因此，D项描述有误。

综上所述，正确的答案是A。