某供水工程承担县级市的主要供水任务，采用管道自流输水；设计输水流量为2m/s，该供水工程的永久性主要建筑物级别不宜低于（  ）。

根据题目描述，该供水工程承担县级市的主要供水任务，并采用管道自流输水，设计输水流量为2m/s。参照相关规范，承担县市级及以上城市主要供水任务的供水工程永久性水工建筑物级别不宜低于3级。因此，该供水工程的永久性主要建筑物级别不宜低于3级，选项B正确。