承包人进度付款申请单应包括哪些内容？

承包人进度付款申请单应包括的内容包括：当期应支付进度款的金额总额，以及截至当期期末累计应支付金额总额和已支付的进度付款金额总额；当期根据支付分解表应支付金额，以及截至当期期末累计应支付金额；当期索赔应增加和扣减的金额，以及截至当期期末累计索赔金额；当期应支付的预付款和扣减的返还预付款金额。因此，选项A、B、C、E都是正确的。而关于质量保证金金额的扣减，是在期末累计扣减的，不是当期应增加的，所以选项D不正确。