根据《标准施工招标文件》中的通用合同条款，承包人有权且只能提出工期和费用补偿的情形有()。

根据《标准施工招标文件》中的通用合同条款，承包人有权且只能提出工期和费用补偿的情形包括施工中遇到不利物质条件和发包人违约的情形。选项C中的施工中遇到文物属于不利物质条件的一种情形，选项E中的施工中遇到不利物质条件也是其中一种情形，因此CE是正确的。而选项A监理人的指示延误、选项B发包人提供的材料和设备提前交货以及选项D发包人未按合同约定支付进度款均不属于承包人有权提出工期和费用补偿的情形。