在项目法人责任制下，下列哪项工作是由项目总经理负责的？

：本题考查项目法人责任制下的职责分工。

在项目法人责任制下，项目总经理负责的工作包括编制项目财务预算、决算。这是项目总经理的职权之一，以确保项目的财务稳健和合规性。

选项A正确，项目总经理负责编制项目财务预算、决算。

选项B“提出项目开工报告”、选项C“研究解决建设过程中出现的重大问题”、选项D“负责提出项目竣工验收申请报告”，这些都是项目董事会的职权，而不是项目总经理的职责。因此，这些选项都是错误的。

综上所述，正确答案应为A。