建设工程承包单位在向建设单位提交工程竣工验收报告时，应出具的文件是（）。

：建设工程承包单位在向建设单位提交工程竣工验收报告时，应出具的文件是质量保修书。这是因为在建设工程竣工验收时，需要确保工程达到设计和合同约定的各项内容，其中需要包括有施工单位签署的工程保修书。因此，D选项正确。其他选项如质量缺陷责任书、质量保证函和质量问题清单并不是提交工程竣工验收报告时必须出具的文件。