关于工程暂停令的签发，下列情形中，总监理工程师应及时签发的是？

总监理工程师应及时签发工程暂停令的情形包括：施工单位未经批准擅自施工或拒绝项目监理机构管理。因此，选项A中的“施工单位未经批准擅自施工”是总监理工程师应及时签发工程暂停令的情形之一。而选项B、C、D虽然也可能需要项目监理机构进行干预，但并不符合工程暂停令签发的直接条件。因此，答案为A。