对于监理工程师对工程延误的处理方式,如果由于承包单位自身的原因造成工期拖延,且承包单位未按照监理工程师的指令改变延期状态时,监理工程师可以采取的处理手段之一是拒绝签署付款凭证。其他选项如及时下达工程开工令、妥善处理工期索赔事件和及时审批施工进度计划,虽然与工程延期有关,但不是针对工程延误的特定处理方式。因此,正确答案是C。