水利工程施工过程中，除专用合同条款另有约定外，下列哪些情形需要进行合同变更？

根据水利工程施工合同的相关规定，除专用合同条款另有约定外，在履行合同过程中，以下情形应进行变更：

A选项：取消合同中的一项工作，但这项工作的取消不能由发包人或其他人实施。因此，A选项不应进行变更。

B选项：改变合同中任何一项工作的质量或其他特性。这是需要进行变更的情形之一。

C选项：改变合同工程的标高，属于改变合同工程的位置或尺寸，因此也是应进行变更的情形之一。

D选项：改变已批准的施工工艺。这属于改变合同中任何一项工作的施工时间或已批准的施工工艺或顺序，因此也是变更的情形之一。

E选项：为完成工程需要追加的额外工作。这也是应进行变更的情形之一。

综上，正确答案为B、C、D、E。