在工程造价管理中的措施项目清单编制，下列哪些措施项目费用是以“项”为单位进行计价？

根据问题描述中的参照解析，我们知道措施项目费用的发生与施工方法或工序相关。而关于哪些措施项目适用于以"项"为单位计价，解析中提到不能计算工程量的项目以"项"为计量单位进行编制。在给出的选项中，已完工程及设备保护费是属于不能计算工程量的项目，因此适用于以"项"为单位计价的措施项目费。所以，正确答案是A。