在土木建筑工程中，采用分部分项工程量清单方式编制的措施项目包括哪些？

根据题目描述和参照解析，为了便于措施项目费的确定和调整，通常采用分部分项工程量清单方式编制的措施项目包括：脚手架工程、垂直运输工程和施工排水降水。因此，选项A、B和E是正确的。而二次搬运工程、已完工程及设备保护不能计算工程量，因此不以分部分项工程量清单方式编制，故排除选项C和D。