根据《建筑工程建筑面积计算规范》(GB/T 50353—2013),建筑物的室内部分,如电梯井、提物井以及附墙烟囱,应并入建筑物的自然层计算建筑面积。而门厅和大厅虽然是建筑物的重要组成部分,但并不属于按建筑物自然层计算建筑面积的部位。因此,正确答案为A、D、E。