根据《广东省建筑与装饰工程综合定额(2018)》规定，在砌筑工程工程量计算规则中，计算某三层砖混结构房屋的以下项目（）均按内墙净长度计算。

根据《广东省建筑与装饰工程综合定额(2018)》规定，在砌筑工程工程量计算规则中，对于三层砖混结构房屋，计算内墙净长度涉及以下几个项目：

A. 内墙下条形基础的基槽土方：此项并不按内墙净长度计算，而是按基础垫层底之间的净长度计算，故A选项错误。

B. 内墙下条形砖基础：此项按内墙净长度计算，符合题意，故B选项正确。

C. 砖砌明沟：此项的工程量是按设计图示的中心线长度以“m”计算的，并不按内墙净长度计算，故C选项错误。

D. 砌墙内墙：此项按内墙净长度计算，符合题意，故D选项正确。

E. 外墙面抹灰：此项是按设计图示尺寸以“m²”计算的，与内墙净长度无关，故E选项错误。